TY  - JOUR
TI  - A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity
AU  - Luke Thompson
AU  - Jon G. Sanders
AU  - Daniel McDonald
AU  - Amnon Amir
AU  - Joshua Ladau
AU  - Kenneth J. Locey
AU  - Robert J. Prill
AU  - Anupriya Tripathi
AU  - Sean M. Gibbons
AU  - Gail Ackermann
AU  - José A. Navas-Molina
AU  - Stefan Janssen
AU  - Evguenia Kopylova
AU  - Yoshiki Vázquez‐Baeza
AU  - Antonio González
AU  - James T. Morton
AU  - Siavash Mirarab
AU  - Zhenjiang Zech Xu
AU  - Lingjing Jiang
AU  - Mohamed Fauzi Haroon
AU  - Jad Kanbar
AU  - Qiyun Zhu
AU  - Se Jin Song
AU  - Tomasz Kościółek
AU  - Nicholas A. Bokulich
AU  - Joshua Lefler
AU  - Colin Brislawn
AU  - Gregory Humphrey
AU  - Sarah M. Owens
AU  - Jarrad Hampton‐Marcell
AU  - Donna Berg-Lyons
AU  - Valerie J. McKenzie
AU  - Noah Fierer
AU  - Jed A. Fuhrman
AU  - Aaron Clauset
AU  - Rick Stevens
AU  - Ashley Shade
AU  - Katherine S. Pollard
AU  - Kelly D. Goodwin
AU  - Janet Jansson
AU  - Jack A. Gilbert
AU  - Rob Knight
AU  - Jose L. Agosto Rivera
AU  - Lisa Al-Moosawi
AU  - John C. Alverdy
AU  - Katherine R. Amato
AU  - Jason Andras
AU  - Largus T. Angenent
AU  - Dionysios A. Antonopoulos
AU  - Amy Apprill
AU  - David Armitage
AU  - Kate A. Ballantine
AU  - Jiří Bárta
AU  - Julia K. Baum
AU  - Allison Berry
AU  - Ashish Bhatnagar
AU  - Monica Bhatnagar
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AU  - Lucie Bittner
AU  - Bazartseren Boldgiv
AU  - Eric Bottos
AU  - Donal M. Boyer
AU  - Josephine Braun
AU  - William J. Brazelton
AU  - Francis Q. Brearley
AU  - Alexandra H. Campbell
AU  - J. Gregory Caporaso
AU  - César Cardona
AU  - JoLynn Carroll
AU  - S. Craig Cary
AU  - Brenda B. Casper
AU  - Trevor C. Charles
AU  - Haiyan Chu
AU  - Danielle C. Claar
AU  - Robert G. Clark
AU  - Jonathan B. Clayton
AU  - José C. Clemente
AU  - Alyssa T. Cochran
AU  - Maureen L. Coleman
AU  - Gavin Collins
AU  - Rita R. Colwell
AU  - Mónica Contreras
AU  - Benjamin B. Crary
AU  - Simon Creer
AU  - Daniel A. Cristol
AU  - Byron C. Crump
AU  - Duoying Cui
AU  - Sarah E. Daly
AU  - Liliana M. Dávalos
AU  - Russell D. Dawson
AU  - Jennifer R. DeFazio
AU  - Frédéric Delsuc
AU  - Hebe M. Dionisi
AU  - Maria Gloria Domínguez-Bello
AU  - Robin D. Dowell
AU  - Eric A. Dubinsky
AU  - Peter O. Dunn
AU  - Danilo Ercolini
AU  - Robert E. Espinoza
AU  - Vanessa O. Ezenwa
PY  - 2017
JO  - Nature
DO  - 10.1038/nature24621
UR  - https://doi.org/10.1038/nature24621
AB  - Our growing awareness of the microbial world's importance and diversity contrasts starkly with our limited understanding of its fundamental structure. Despite recent advances in DNA sequencing, a lack of standardized protocols and common analytical frameworks impedes comparisons among studies, hindering the development of global inferences about microbial life on Earth. Here we present a meta-analysis of microbial community samples collected by hundreds of researchers for the Earth Microbiome Project. Coordinated protocols and new analytical methods, particularly the use of exact sequences instead of clustered operational taxonomic units, enable bacterial and archaeal ribosomal RNA gene sequences to be followed across multiple studies and allow us to explore patterns of diversity at an unprecedented scale. The result is both a reference database giving global context to DNA sequence data and a framework for incorporating data from future studies, fostering increasingly complete characterization of Earth's microbial diversity.
ER  -